1、进行种子消毒处理。播种前，可用种子重量0.2%的50%福美双可湿性粉剂或35%甲霜灵拌种剂配合倍加倍1000倍液拌种，或将种子放入50℃温水中浸20分钟，取出放入冷水中，然后沥水晾干再进行播种。
2、加强田间管理。适时播种，适期、适度蹲苗。合理浇水，避免土壤过早、过涝，及时防治地下害虫。注意减少伤口，收后及时清洁田园。
3、做好田间病残体清除。在疏苗、间苗和旺长期要注意检查，发现病弱株要及时拔除。之后要及时喷洒含铜的杀菌剂配合倍加倍1000倍液对叶面喷施，提高植物抗病能力，减少病害蔓延。
4、适当轮作倒茬。萝卜黑腐病一旦发生，其病菌会在土壤中连年存活，导致下一茬的萝卜继续遭遇病害，所以适当的轮作倒茬在这个时候很有必要。