1.选择合适的抗病品种是防止小麦条锈病发生最有效的方法。
2.5月的降水量是影响青海省小麦条锈病的发生面积和发生程度重要的气象条件，5月中、下旬的中心病株是提供条锈病菌源的供体，是影响小麦条锈病发生、流行的关键；这一时期坚持实行带药侦查，及时拔除中心病株并实行全田防治是控制小麦条锈病的关键技术手段，可起到事半功倍的作用。
3.在冬小麦种植区使用三唑酮实行秋播拌种，控制秋苗染病；
4.每年5、6月的关键时期使用三唑酮、烯唑醇、丙环唑等药剂实行统防统治，是控制菌源、防治小麦条锈病扩散流行的重要措施。
5.根据小麦品种、生长状态和条锈病发生和预报情况，因地制宜选择药剂、浓度和施用方法。