火龙珠和红果金丝桃可以通过两者的种属划分、形态样式、主要价值等方面进行区别。火龙珠为金丝桃科、红果金丝桃属于藤黄科。火龙果珠是低矮灌木，红果金丝桃是常绿灌木。两者都有较高观赏性，但火龙珠的果实还能带来经济价值。
火龙珠是金丝桃科植物的一个变种。虽然生长旺盛，但属于有限生长型。除赏花外，水果的利用率也很高。红果金丝桃是滕黄科金丝桃属植物，与火龙珠的种属有明显区别。红果金丝桃是一种常绿灌木，可长到1.2米。
火龙珠是一种低矮灌木，叶单生、对生或轮生。叶片为厚实的纸质形态，花以黄色为主，果实鲜红有光泽。红果金丝桃是一种常绿灌木，其叶为对生的椭圆形或卵形，聚伞花序顶生。但它的花和果实的颜色和火龙珠颜色一样。
火龙珠的价值主要体现在观赏性上。此外，其商品价值高，酸甜适中，口感好，便于运输和储存，具有较高的经济价值。红果金丝桃的观赏价值体现在景观利用上，许多人将其作为切花或插花。