沙糖桔花芽分化时间在十月初，在十月底的时候，沙糖桔的枝条就进入生理分化期，花芽分化分为两个部分，一个是生理分化期，还有一个是迟于生理分化期的形体分化期;在翌年的一月初至二月底，沙糖桔就开始进入形体分化期。
生理分化期是指在果树生长过程中，所累积的养分，是形体分化期的基础;形体分化期是指，花芽逐渐生长出花丝、花蕊、花瓣、花萼等一系列花朵特征，直到最后生长成一个孕育果实的容器。
在沙糖桔花芽分化时，不能大量的浇水，需要严格控制浇水的次数，大概10天浇水一次即可;浇水时不能直接喷洒在花芽上，以免让处于分化阶段的花芽受到伤害，可以直接将其浇灌在泥土中。
在沙糖桔花芽分化时，不能直接喷洒农药在花芽上，以免结出的果实含有农药残渣，可以等待花芽孕育出果实后再使用农药;如果分化时正遭受虫害，可以使用磷酸二氢钾农药，早晚各喷洒一次，坚持一个星期就能解决虫害。