我省水稻中后期主要病虫害有稻瘟病、纹枯病、稻螟、稻飞虱等，其次有稻曲病、稻粒黑粉病、云形病、叶鞘腐败病、叶黑粉病、叶尖枯病、稻纵卷叶螟、稻蝗、稻苞虫、稻秆蝇、粘虫等。药剂防治的重点抓“保叶、保穗”，尽可能选用高效、低毒、低残留的药剂，搭配生物制剂，病虫兼治，一次性施药，降低成本，减少污染。针对主要病虫对象，可采取以下防控措施。
1、稻瘟病主要在我省盆周丘陵、山区发生，常年发生面积400万亩左右，病害大流行年损失稻谷数亿公斤以上，以苗叶瘟和穗颈瘟危害较重，穗颈瘟对产量影响最大。主要防治措施：①选用抗耐病品种最经济有效。②利用生物多样性原理，推行抗感品种混植间栽技术，减少损失，保产增收。③水稻移栽前喷施1次“免深耕”土壤调理剂，移栽后分别在分蘖期、拔节期、孕穗期各喷洒1次“金镰刀”或“硕丰481”，促蘖保穗，提高抗性。④科学用药：本田期“挑治叶瘟，主治穗颈瘟”。防治重点是常发病区，种植感病品种的叶瘟发病田和相邻稻田。穗颈瘟防治适期掌握在水稻孕穗末期喷药保护，一般施药1—2次。主要药剂建议选用20%加收米液剂、75%丰等、75%金卓可湿性粉剂、20%三环唑、40%富士1号等，每亩兑水50公斤，叶面手动喷雾或大面积机动弥雾，喷药要求均匀周到。
2、纹枯病在我省盆东北和盆西南稻区发生危害较重。近年来，推广旱育秧、免耕栽培技术后，有利于病害的发生危害，特别是平原坝区，在高温、高湿、重施氮肥条件下，为害损失较重。目前，防治措施上因缺乏高抗品种，主要采取“水控药治”，即田间控制水肥结合适期施药防治。主要药剂可选用25%粉锈通和爱苗可兼治稻云形病、稻曲病、稻粒黑粉病、叶黑粉病、叶鞘腐败病、叶尖枯病等中后期病害。施药时期在水稻分蘖至孕穗期。防治指标：稻丛发病率，常规稻为20%左右，杂交稻为30%以上。施药1—2次，每次间隔10—15天，采取稻株间和叶面喷雾，重点喷施稻株中下部，要求均匀无漏喷。
除此，在水稻移栽后一段时间，有些地方秧苗出现“坐蔸”现象，可喷施“高能红钾”或“美多收”增产素，提高稻株抗性，促进早生快发，孕穗期还可增施1次，促穗大粒重。
3、水稻螟虫我省水稻螟虫有二化螟、三化螟、大螟等，以二化螟为主，局部稻区三化螟有上升危害势头。防治措施除除采取消灭虫源外，主要是药剂防治。第一代二化螟防治时期，盆西北稻区在5月中旬至6月上旬；防治指标：稻株枯鞘株率达3%-5%时防治。第二代二化螟应选择第一代二化螟秧田防效差、移栽后来不及防治的田块，或秧田漏治的田块和局部稻区有三化螟的田块进行防治。防治时期：盆西北稻区二化螟在7月中、下旬，三化螟在7月上、中旬。防治指标：二化螟以枯鞘率达5%左右；三化螟在乱盛孵初期进行防治。主要药剂可选用20%漩星乳油或22%切虫乳油或5%锐劲特悬浮剂、虫无影、螟死净、bt乳剂、巨雷等。在稻螟尚未对药剂产生抗性的稻区，杀虫双、杀虫单、比双灵等仍可使用。其中漩星、切虫、锐劲特、虫无影、螟死净等可兼治稻飞虱、稻纵卷叶螟、稻蝗、稻苞虫等。选用上述药剂，每亩兑水50公斤，常规喷雾或机动弥雾。施药部位重点是水稻中下部，注意保持田间水层，才能达到较好的效果。
4、稻飞虱属迁飞性害虫。我省发生危害主要是白背飞虱和褐飞虱，随气流传入，通常在盆东南稻区发生危害，特大发生年可波及盆西稻区。防治措施，除推广抗虫品种外，重点是药剂防治。防治时期，白背飞虱在7月上中旬，褐飞虱在8月上中旬。防治指标：稻百丛虫量1500头以上。主要药剂：可选用20%漩星乳油、22%切虫乳油、10%吡虫啉、25%扑虱灵可湿性粉剂，或5%锐劲特悬浮剂等，采用液面喷雾，重点喷洒稻株中下部，才能取得较佳防效。