1、耳木起架管理：必须要协调好耳场的温度、湿度、光照和通气条件，但是水分管理是增产的关键。这时要求干干湿湿的外界环境，头两天早晚要浇足水分，以后根据情况适当浇水，一般在晴天多浇水，阴天少浇水，雨天不浇水，每次浇水时要细雾状，巡回浇，全浇，浇足，使耳木吸足水分。天晴温度高时，应早晚喷水，避免在阳光强烈的中十浇水，以免造成烂耳。耳场空气中相对湿度控制在90％～95％为宜。这样10天左右子实体便可长大成熟。
2、黑木耳每潮收后应停止浇水：让阳光照射3～5天，使耳木表面干燥，氧气从裂缝进入，促使菌丝恢复生长，并向耳木更深的部分蔓延生长。然后再浇水管理，大约经10～15天，可采收二潮木耳。
3、木耳的越冬管理：段木栽培黑木耳时间较长，一般是一年种三年收，当年初收，翌年大收第三年尾收。每年秋末冬初，气温下降，菌丝生长缓慢乃至休眠，停止出耳，即进入越冬期。这个时期的管理方法是将耳木集中，仍按井叠式等堆放在清洁干燥处，上面覆盖草或树的枝叶保温保湿，防止严冬低温危害菌丝，若天气干燥应向耳木上适当喷水保湿，到来年春天气温回升后，耳木上发生耳芽时，再散堆上架，精心管理，待成熟后采收。