1、选用抗病品种，培育无病壮苗抗病品种有效的减轻病害发生程度，也是防止辣椒死秧的重要措施，培育无病壮苗，发根力强，能避免或推迟辣椒发病。
2、控制病源菌实行轮作换茬，减少土传病害，对种子和育苗营养土进行严格的消毒。
3、科学管理，增强植株抗逆性深翻土地，基肥要施足、施匀，不施没有腐熟的有机肥，追肥以少量多次为原则，要浅水灌溉，快灌快排。田间积水不应超过40分钟，防止受涝受渍，避免高温时浇水，不要灌入有毒废水。
4、搞好田间清洁，减少病害再次侵染循环经常铲除田间和田埂的杂草，保持田间清洁，发现病株应及时拔除，带出田外深埋，在病株周围进行消毒。
5、化学防治疫病，用25%瑞毒霉800倍液，40%乙磷铝500倍液喷洒，枯萎病用50%托布津200倍灌根，立枯病用百菌清500倍液或托布津800倍液浇根。要7-10天防治1次。