红南瓜花瓜现象近两年时有发生，花瓜与红南瓜种子没有直接的因果关系，主要与病毒病侵染和菜农在红南瓜种植中病虫害预防不到位有关。
防治红南瓜花瓜首先要从了解该品种的生长特性入手，红南瓜是一种耐温但不耐热的瓜类品种。要早育苗，每年的3月上中旬是育苗的最佳时期。定植后遇高温，蚜虫危害重时，易染病毒病，很难坐瓜，一旦坐瓜晚极易产生花瓜。红南瓜的生长适宜温度一般在25℃左右，超过30℃以上未坐瓜极易产生花瓜。另外，在育苗时一定要把握好时间，育苗期均在28天左右，定植时间不应超过每年的4月10日(廊坊地区)。4月下旬是落膜时节，也是红南瓜伸蔓生长阶段，这段时间气温极不稳定，忽高忽低。26日在廊坊及保定部分区域竟出现32度的高温，极易造成蚜虫大爆发，诱发虫害及病毒病的发生。病毒病除蚜虫传播外还包括空气传播等，花瓜大多与病毒病有关，因此对蚜虫、白粉虱等要提早防治。预防蚜虫、白粉虱，可选用5%吡虫啉30-40毫升/亩进行叶面喷雾;预防病毒病，可选用吗胍·乙酸铜250克/亩均匀喷雾，一般喷施2-3次，间隔5-7天。采取上述措施以后，红南瓜花瓜现象就会明显减少。