烧心生长发育前期较少出现，一般在植株11~12片叶时发生，该病主要是由缺钙引起的。夏季栽培的芹菜易发生烧心。防治方法：应从管理入手，做到温湿度适宜，对酸性土壤要施入石灰，将其调成中性，发病初期可喷洒0.5％的硝酸钙溶液。
空心芹菜空心是一种生理老化现象，多发生在沙壤土菜地里，一般发生在植株生长中后期。此外，干旱时芹菜也易发生空心现象。防治方法：应选择非沙性土壤种植，种植前施足腐熟的有机肥，适时追肥，发现芹菜叶色浅、脱肥时，可喷洒0.1％的尿素溶液2~3次。
叶柄开裂该病由土壤缺硼或在低温、干旱条件下植株生长受阻所致。此外，植株吸水过多时，若突遇高温、高湿天气，会使组织快速充水，造成叶柄开裂。防治方法：施足充分腐熟的有机肥，每亩施硼砂1公斤，与有机肥充分混匀；叶面喷施0.1％0.3％的硼砂溶液，并在管理时注意均匀浇水。