目前大多数杀线虫药都是剧毒的，或污染环境，或有高残留，因此必须坚持以农业、物理和生理的防治方法为主。
①实行计划轮作。根据一种线虫只能为害少数寄主的特点，实行与黄瓜远缘作物如韭菜2～3年的轮作，就可以断绝线虫的食源，使其无法生存。
②深翻。利用根结线性虫主要分布在3～9cn的表层土中这一特点，深翻或起出0～20cn耕层土，可减轻为害。
③高温处理。利用线虫在55℃下，只要5min就可以致死的特点，或者采用消灭枯萎病的夏季撒石灰，铺稻草、淹水、覆膜放高温的方法进行处理；或者用开水逐畦浇灌将其杀死。
也可以采用烧烤土壤来消灭线虫。方法是：利用温室夏季休闲期，将土壤深翻但不打碎坷垃，在地面铺放15～20cn厚的麦糠或稻壳，如有废弃的糠醛渣盖到上面更好，四周铺放压上细软的柴禾。点燃细软柴禾，保持暗火慢慢燃烧。发现明火可用土压住，1个温室大约经过3～4d可燃烧完毕，此间最好要经常监视。燃烧中可使20cn土层的温度达到70℃以上，足以杀死线虫。
高温处理后。特别是烧烤过的土壤，由于大量有机质和有益微生物也被损失。因此，处理结束要抓紧施人农家肥，至少要有1个月以上的时间，使土壤有机质和有益微生物得以恢复
④淹水处理。改种一茬水稻，也可以使线虫被淹死。利用温室夏季休闲期，将地面淹水，并用1个装有泥沙的塑料编织袋在水中反复拖拉，使地面形成密封的泥湖，以尽量封闭地面，这样在多水和几近缺氧的情况下，也可以降低线虫的密度。
⑤培育无毒壮苗。一是选用无病原的土进行育苗；二是采用滴滴混剂或物理方法提前处理床土。
⑥定植15d前，在定植地块按30cn开沟，用滴滴混剂600kg/hm2，喷洒植沟内，而后覆土压实，半月后扒开沟放气2～3d，放出残留药，然后起垅定植。或定植前，在垄上穴施10%粒满库颗粒剂，用量为75kg/hm2。
⑦温室休闲期种植万寿菊作绿肥翻入土中，掩埋严实。据日本专家介绍，种植时可使虫口密度下降到5%，压青后可控制根结线虫为害5年左右。
⑧灌用百事达2442。百事达2442其内含有可溶解几丁质的芽孢杆菌，在土壤当中大量繁殖后，可将根结线虫卵壳中的几丁质破坏，致使孵化失常，从而达到防治的目的。
百事达的使用方法是：定植时在定植穴内撒用虾蟹壳粉，每穴用2g；用百事达100倍液浸蘸苗坨或根部2min。定植后，按每平方米用百事达原液2ml，加虾蟹壳粉20g,对水适量，以稳苗水的形式浇到定植穴上。1周后，再用百事达100倍液灌根1次。经1周再用百事达灌用1次。
⑨灌用齐螨素与滴滴畏混合液。按50kg水内加入1.8%齐螨素30ml，80%滴滴畏乳油50ml，在定植时灌根1次，1个月后再灌1次，每次每株用药液250～500ml。