施基肥播种前应深耕，施足基肥。施用的方法有撒施和沟施两种，凡施用固体肥料，都应与细土掺匀后混施。基肥对肉质根的形状影响较大，化肥用量多而有机肥少时，畸形根比例明显增加;增施腐熟有机肥做基肥，可以减少畸形肉质根的形成。
巧施微肥胡萝卜对钙的吸收较多，但钙含量过多，会使胡萝卜糖分和胡萝卜素含量下降，钙含量过少还易引起空心病。胡萝卜对镁元素的吸收量不多，镁含量越多，其含糖量和胡萝卜素含量也越多，品质就越好。可分别于幼苗期、叶片生长盛期各喷施一次钙镁磷肥，同时配合喷施新高脂膜粉剂，提高肥料有效成分的利用率。
合理追肥胡萝卜除施足基肥外，还要追肥。生长后期应避免肥水过多，否则易造成裂根，也不利于贮藏。追肥可随水灌入，也可以将人粪尿加水泼施。同时喷施地果壮蒂灵，使地下果营养运输导管变粗，提高地果膨大活力，促进果型健壮，优质高产。