黄瓜菌核病又叫烂尖病，露地、保护地黄瓜均可发病，在保护地中发病最重。一般损失10%～30%，严重地块达90%以上，致使有些大棚黄瓜绝产。低温、高湿或多雨的早春是该病的高发季节，必须加强防治。
发病症状
从苗期到成株期都能发生此病，主要危害瓜果，也能危害茎蔓、叶片和花等部位。瓜果受害，先在残花部产生水渍状不规则形病斑，以后黄瓜尖变软腐烂，在腐烂的果实表面长出棉絮状白色菌丝体，并形成黑色鼠粪状菌核。茎蔓受害，多在主茎中、下部或主侧枝分叉处产生水渍状浅褐色病斑，稍凹陷，以后逐渐变成白色，在高湿条件下，病茎软腐，长出白色棉毛状菌丝，受害部位以上的茎蔓和叶片凋萎枯死，最后茎秆内髓部被病菌破坏腐烂而中空，并产生白色菌丝体和鼠粪状菌核。
综合防治
1.农业防治。与水生蔬菜、禾本科及葱蒜类蔬菜隔年轮作。收获后彻底清除病残体，带出田外深埋或烧毁。并深翻土壤25厘米以上，将菌核埋入深层，抑制子囊盘出土。病地可利用夏季进行10天以上的灌水浸泡，促进菌核腐烂。同时采用配方施肥技术，增强植株抗病力。
2.物理防治。播种前用10％盐水漂种2～3次，淘除菌核。采用紫外线棚膜，可抑制子囊盘出土及子囊孢子形成。也可采用高畦覆盖地膜的栽培方式抑制子囊盘出土及释放子囊孢子，减少菌源。
3.种子和土壤消毒。定植前用40%五氯硝基苯配成药土耙入土中，亩用药1千克兑细土20千克，拌匀撒入定植穴；种子用50℃温水浸种10分钟，即可杀死混杂在种子中的菌核。
4.生态防治。棚室栽培时，上午以闭棚升温为主，温度不超过30℃不要放风，下午及时放风排湿。发病后可适当提高夜温来降低结露时间，早春日均温可控制在29℃或是31℃高温，相对湿度在65%以下可减少发病。防止灌水过量，土壤湿度大时可延长灌水间隔期。
5.茎部涂抹防治。当菌核病感染茎部时，可以先用刀片将病茎处把长白毛的腐烂处刮除，再用50%速克灵或扑海因药剂，用水稀释20～30倍药液如浓奶浆状（也可用少量食用淀粉糊与药粉以2：1比例加水混匀），涂抹患处，一般涂药1次后，病患处组织会慢慢自行愈合，植株能正常继续开花结果。如果病患处腐烂比较严重，3～5天后看情况也可再涂1次药。通常病茎腐烂程度不到其直径一半的植株，都可以救活且以后还可维持一定的产量。
6.药剂防治。发病初期，用10%速克灵烟剂或45%百菌清烟剂，每亩次250克，熏1夜，隔8～10天1次，连续或与其它方法交替防治3～4次；用5%的百菌清粉尘剂进行喷撒，每亩次用1千克左右；也可用50%的农利灵可湿性粉剂1000倍液，或60%防霉宝超微粉600倍液，或50％扑海因可湿性粉剂1000倍液，或70％甲基托布津1000倍液等进行喷雾，每7～10天1次，连喷3～4次。