1、选好优质棉种种子包衣前首先要备好符合国家质量标准的良种。健籽率要达到80％以上，发芽率要达到85％以上。然后进行泡沫酸脱绒，脱绒后的种子残绒要控制在80％以内，残酸率控制在0．15％以下。
2、选择适宜的种衣剂剂型农业部农技推广服务中心向全国棉区推荐适合棉花包衣的优质种衣剂为德国拜耳公司的高巧、北农大涿州种衣剂厂的30％呋多甲，河南省中原种衣剂厂的24％呋多酮。以上三种剂型用于棉种包衣效果较好，且均属三证齐全的合法产品。
3、掌握包衣种子播种技术：
1）掌握播种时期包衣种子一般要求5天连续地下5cm地温，稳定通过14℃并在短期内能上升到16℃以上时播种为宜。同时，为防止阴雨天低温高湿造成烂种，应尽量选晴天播种。
2）播种前不能浸种包衣种子播前浸种易使种膜脱落，而失去包衣效果。同时，浸种后吸水过快，经试验：浸种24小时后，吸水即可达种子自身重量的80％，播种后不像毛籽能与土壤间产生空隙，散发水分。因此极易烂种而影响出苗。
3）播种前底墒要足因包衣种子不能浸种，故底墒一定要选好。播种时要求田间持水量要达到70－80％，以保证种子吸收足够的水分而正常出苗。
4）播种深度要适当包衣种子与毛粒相比，播种深度要浅些，一般要求沟播，开沟深度为5cm，露地覆土3cm，地膜覆盖覆土2cm为宜。机播或耧播大致如此。另外，黏土墒情好宜浅，砂地墒情宜深。
5）保证用药安全播种时人的皮肤避免直接接触包衣种子，以免中毒，要保证安全用药。
最后，需要注意的是，如果用手工少量包衣时，可按使用说明要求，按规定药种比在容器或塑料袋中进行。包装时要戴好口罩和长筒乳胶手套，以免造成人员中毒。同时，要将包衣后的种子妥善保存，以免发生意外。