随着种植年限增长，重茬严重，设施内蔬菜出现死棵的现象越来越多，比如黄瓜、西红柿、豆类等主要品种，都存在严重死棵问题。死棵的主要原因：1、盐渍化加重；2、病原菌增多；3、线虫危害；4、管理不当造成沤根、烧根。
土壤恶化原因分析
棚内地表变白、红、绿，甚至五颜六色，主要原因就是土壤盐渍化，含盐量过高。这是由于长期大量施用化学肥料，导致土壤中养分失衡，某种或某几种营养元素严重超标，如部分大棚中钾肥含量超过2000mg/kg，部分营养元素则不足，已经影响到了蔬菜正常生长，这也是近年来蔬菜黄叶、僵果等生理性病害多发的根本原因。土壤含盐量过高，还导致蔬菜吸水更加困难，蔬菜长势弱，产量低。
除了土壤盐渍化，由于重茬严重等问题，还导致土壤中病原菌、自毒物质积累，有机质下降，耕作层变浅，土壤透水透气性、保肥性下降，理化性状变差，污染物增加，根部病害高发。水、肥、病、气……都出了问题，蔬菜根系的生长可谓是“多灾多难”。
蔬菜萎蔫死棵的表现全株萎蔫死亡是所有萎蔫的最终结果，先期早晚恢复、中午萎蔫，反复数日，植株全株萎蔫死棵。根部病害种类：疫（腐）霉根腐病、腐皮镰孢菌根腐病、枯（黄）萎病、茎基腐病、青枯病。
1、疫霉根腐病
主根上发病。病株从主根上出现小黑点，后来发展成大片黑斑。典型症状：黑褐色湿腐，严重的茎杆溢缩。纵向劈开，会发现导管是深褐色的。西红柿、彩椒茬比较常见，并且主要在秋延迟这一茬多发。
防治药剂：72%克露500倍液；72.2%普力克600倍液；52.5%抑快净2000倍液；20%氟吗啉1500倍液；50%烯酰吗啉500倍液等
2、腐皮镰孢根腐病
这几年发生的比较多，也是在西红柿和椒上多发。
在主根或较大的侧根发病，病株根茎部及根部皮层呈深褐色腐烂，最大的特点就是用手一撸根系，其表皮极易剥落，露出木质部。如果横切茎观察，也能看到维管束变色。一般发生在夏秋定植以后，发生较晚，到深秋或冬季开始陆陆续续出现。
防治药剂：53.8%氢氧化铜1000倍；20%甲基立枯磷1200倍液；30%恶霉灵1000倍液；25%氰烯菌酯1000倍。
3、枯（黄）萎病
以前茄子发生黄萎病比较严重，现在大都采取嫁接，发生的较少了。现在西红柿和彩椒发生多一些，尤其是西红柿枯萎病特别厉害。由于西红柿最近几年病毒病发生比较严重，都种植抗病毒病品种，但是抗病毒病一般都不抗枯萎病。
枯萎病的症状主要就是从根尖开始，一般在开花前后，病株下部分叶片逐渐干枯脱落。根部表层出现水渍状腐烂。
防治药剂：77%硫酸铜钙（多宁）500倍液；50%氯溴异氰尿酸1000倍；25%氰烯菌酯1000倍。
4、茎基腐病
茎基腐病一般发生在定植初期，秋茬彩椒发生较严重。典型的症状：为害茎基部，初期表皮变成深褐色，发黑，成水侵状，一开始黑斑，然后慢慢绕进一周失水干缩，植株就死亡了。
定植初期秋茬彩椒发生很多。与底肥有关，我们施用大量粪肥，那时候温度高，地温也比较高，浇水之后，粪肥腐熟发酵释放大量的热，并且一些有害气体从地表往上走，首先为害茎基部，所以如果发现粪烧苗了，茎基腐病发生就会严重。
防治药剂：20%甲基立枯磷1200倍液；30%苯噻氰（倍生）1000倍液；35%甲霜·恶霉灵（秀苗）1000倍液。
5、青枯病
青枯病是一种细菌性病害，典型的症状就是挤压的时候出现菌脓。近些年比较少见，因为土壤酸化，细菌在土里存活的比较少。
防治药剂
铜制剂：DT（琥胶肥酸铜）、王铜（氧氯化铜）、可杀得（氢氧化铜）、噻菌铜等。
抗生素：中生菌素、春雷霉素、链霉素。
噻唑锌、叶枯唑
铜制剂没有抗药性，是一种保护性杀菌剂，但没有内吸性，只杀死植物表层的病菌。而抗生素类和噻唑锌、叶枯唑有内吸性，所以可以和铜制剂混在一起用。铜制剂还有一个好处，就是可以防治细菌从伤口感染，所以在整枝打杈之后用药可以配上一些铜制剂，预防病害发生。