太阳光消毒法
夏季高温季节，利用闲茬时期，撤掉温室覆盖薄膜，彻底清洁田园、铲除所有枯枝败叶、病株残体，将整栋温室的骨架、墙体及土壤裸露于光照下，利用阳光紫外线进行杀菌消毒。
熏蒸法
在预备进行秋冬茬蔬菜育苗前一周，可用硫磺粉熏蒸消毒的方法对温室空间和农具进行消毒，具体方法为：每亩用硫磺粉1000克加锯末混合，拌匀后分放在温室各点，将所用农具架杆等也一并放入温室。暗火点燃后密闭温室熏蒸12小时。或用45%百菌清烟雾剂每亩用药1000克熏蒸温室，熏蒸后仍密闭温室7-10天消毒灭菌，定植或播种前1-2天打开通风口通风。如每亩用药200-250克熏蒸，可在温室播种前分3次进行，每次间隔时间1周。
化学药剂
用福尔马林300-500倍液对温室内的墙体骨架及各部位和角落实行喷洒消毒，喷洒7天后打开通风口通风，15天后即可使用。