红薯病毒病从红薯苗期就开始发生，剪苗后再生薯苗发病更为严重。发病的薯苗插于大田后，长势弱、产量低，一般减产幅度在六成以上，严重影响产量。
防治红薯花叶病毒病，一是更新良种，改用脱毒、抗毒（或耐毒）红薯优良品种。二是对脱毒红薯种单独育苗、单独栽插、单独收获、单独贮藏；据《农资淘宝指南》介绍在红薯生长期，给作物表面喷洒新高脂膜粉剂，可有效预防红薯病毒病及蚜虫、烟粉虱等害虫，避免脱毒种薯感染病毒。三是必须选健康种薯育苗；育苗过程中发现花叶苗，或插至大田后发现病苗应及时拔除。四是通过精细整地、高垄栽培，增施钾肥、平衡施肥，浇水抗旱、覆草保墒等农业措施，改进栽培管理技术，增强红薯抗病能力。在苗期喷洒地果壮蒂灵液体，对薯苗做叶面喷雾辅助治疗，对增强薯苗长势，提高产量有一定效果。