苹果树的修剪分生长季修剪和休眠期修剪。生长季修剪又分春剪、夏剪和秋剪。春剪多在萌芽期至花期进行。通常是采用刻芽、抹芽、疏枝、回缩等措施来完成。其作用是缓和树势，提高萌芽率，促生中短枝，提高坐果率。春剪的去枝量不大，只是对冬剪的补充。也有人称春剪叫“花前复剪”，也可以结合疏花进行。夏剪和秋剪多采用摘心、扭梢、拉枝、拿枝、捋枝等措施，缓和树势，改善光照条件，促使花芽分化，培养结果枝组，提高坐果率，改善果实品质，有利于树体营养的积累与贮存。
休眠期修剪又叫冬季修剪。时间是从冬季落叶后至春季萌芽前。采用的方法有疏枝、短截、回缩等。“疏枝”就是将多余的枝条从基部剪掉；“短截”是剪去一年生枝条的一部分。剪去枝条的三分之一叫轻度短截，剪去枝条二分之一叫中截；剪去枝条的三分之二叫重截。“回缩”则是对已趋衰弱的多年生枝条在比较健壮侧枝前，将顶端枝剪掉。采用这些方法的目的就是疏除密生枝、徒长枝；短截中心领导枝和骨干枝，平衡树势，扩大树冠，增加结果部位；对进入结果期的骨干枝适度回缩，复壮树势，延长结果年限。