一、表现症状
大葱锈病多在生育后期发生，通常危害不重。但若大面积连片种植感病品种，或发病较早，也可导致大流行，造成严重减产。主要危害叶片、叶鞘和花茎。病部最初出现椭圆形褪绿斑点，不久后由病斑中部表皮下生出圆形稍隆起的黄褐色或红褐色疱斑，称为夏孢子堆。疱斑的表皮破裂翻起后，散出橙黄色粉末状夏孢子。夏孢子堆圆形、近圆形，长2～3毫米，宽0.5～1毫米，密度高时，可互相汇合成片，使叶片提前枯死。植株生长后期，病叶上形成长椭圆形稍隆起的黑褐色疱斑，内部生有褐色冬孢子，称为冬孢子堆。
二、发病规律
在温暖地区可周年发生，病原菌的夏孢子随气流和雨滴飞溅传播，在葱属蔬菜间辗转危害。冬季寒冷地区主要以菌丝和夏孢子堆在越冬大蒜、留种大葱植株上越冬。冬季天暖多湿时仍能生长和侵染，但症状表现所需时间较长，发病率较低。有些地方，病原菌的夏孢子还可以在田间植物残体上越冬存活。春季气温回升后，越冬植株上产生新一代夏孢子，随风雨传播，侵染邻近植株和附近田块，在田内出现发病植株集中的区域，即“发病中心”，成点片状分布。在整个春季能多次侵染；夏季高温，以菌丝体在病叶内越夏。秋季又陆续侵染，再度流行。植株密度大，偏施水肥，田间郁蔽，或者地势低洼，易于积水等都有利于锈病流行。品种间抗病性也有明显不同。