黑木耳是东北的主要食用菌，在栽培过程中，往往产生杂菌，严重影响黑木耳的产量。只有了解黑木耳的主要杂菌并知道造成杂菌污染的原因，才能防止杂菌的生成。
1耳木上常见的杂菌
1.1牛皮箍属草菌类，多为栗壳色（边缘黄褐色），少为笋片色。子实体紧贴在耳木上，边缘不翘，状似贴膏药，严重时，贴满耳木，引起木质部粉状腐朽。长有此菌的耳木不产生耳芽。此苗在潮湿和连续阴雨天气发生严重。
1.2金边蛾也称褐轮韧草菌。子实体的基部贴在耳木上，边缘翻起如檐状，黑色表面形似干的黑木耳，贴着耳木的不孕面呈灰红色。在阴湿多雨天最易发生。
1.3黑疗是危害壳斗科耳木的主要杂菌。多出现在耳木表皮的纵沟中，呈黑色的线状疙瘩，逐渐变为瘤状半球体。耳木上生了黑疗以后，吸不进水，耳木里面成“铁心”，不仅不能结耳，其它杂菌也不能在其上生长。高温及排场过湿，荫蔽过大地方的耳木易发生。
1.4红孔菌亦称朱红栓菌。子实体基部狭小无柄，菌盖半圆形，橙色至红色，可引起粉状腐朽。菌丝初为白色，逐渐变为红色，分泌黑褐色色素，多发生在高温、干燥的环境里，繁殖迅速，分解木材组织的能力强，危害严重，生长此菌的耳木难产生黑木耳子实体。
其它杂菌如胶孢菌、裂褶菌等，争耗养分，分泌有害物质，影响木耳菌丝生长、子实体形成和生长，能造成木耳严重减产。
2黑木耳栽培中易造成杂菌污染的主要原因
黑木耳是一种喜温、湿的胶质菌，它在栽培中易遭杂菌污染是和它的习性分不开的。
黑木耳一是生产周期较长，袋栽需100～120天；二是抗杂菌能力差，子实体、菌丝和菌料常成为杂菌孽生场所；三是其子实体生长发育阶段，需要有持续的较高温度（20～28℃）和湿度（85%～90%），在上述温、湿条件下，从子实体形成到采收需要15～20天，这样条件也有利杂菌的孽生蔓延。
我们要根据黑木耳生长特性和杂菌的特点，采取一系列的必要措施，加强科学管理，防止黑木耳遭到杂菌危害。