蘑菇在生长过程中常会因气候不适宜，管理不善而发生生理性病害。现将常见的几种生理性病害的成因和防治方法介绍如下：
空根白心菇菇房喷水少、湿度小，覆土层含水量不足，子实体得不到充足的水分，菌柄就会产生白色髓部，甚至空心。防治：适时喷水；出菇期菇房保持在85%以上的相对湿度，可防止空根白心菇的发生。
水锈斑菇每次喷水后，未及时打开窗户通风换气，菇房湿度过大，蘑菇表面出现小水滴，时间一长，就形成锈色斑点。防治：保持室内空气新鲜，喷水后要开门窗通风0.5~1小时。
红根菇出菇前高湿阶段用水过多，覆土层含水量过大，或栽培养料pH值偏小，或追施葡萄糖过多，通风不良，都易生红根菇。防治：是将覆土的含水量保持在22%~25%，可适当喷些石灰清水，追肥要适当。
硬开伞、早开伞昼夜温差达10℃，或遇冷空气袭击，均会造成硬开伞。如出菇密度过大、温度偏高或湿度偏低就会提早开伞。防治：在温度骤变时，房外应加盖草帘，保持菇房适宜的温湿度。
地蕾菇培养料进房时湿度过大，覆盖细土过迟、温度较低，易产生地蕾菇。防治：应掌握喷水量、通风量，使菌丝吊在粗土之上，细土之下。
畸形菇通风不畅，菇房内二氧化碳含量超过0.3%，易出现畸形菇。防治：在管理上要注意菇房通风。