利用牛粪加工有机肥，首先要把牛粪晾晒或沥干，使其水份控制在85%以下，然后加入秸秆末，牛粪和秸秆末的比例为7:3，使原料（牛粪）辅料（秸秆末）的碳比控制在23~28，含水量控制在52%~68%。最后再加入有机肥发酵腐熟剂。
原料和辅料及菌剂混合搅拌后，可上堆发酵，上堆的要求是将混合料在发酵场上堆成底边宽1.8~3米，上边宽0.8~1米，高1~1.5米的梯形条垛，条垛之间间隔0.5米。条垛堆好以后，在24~48小时内温度会上升到60度以上，保持温度48小时开始翻堆。翻堆时务必均匀彻底，将低层特料尽量翻入堆中的中上部，以便充分腐熟。
第一次翻堆后，以后每星期都要翻堆一次。但是，当温度超过70℃时，必须立即翻堆，否则有益微生物及发酵菌会被大量杀死，不利于发酵腐熟。全部发酵腐熟的标准：
一是看颜色，一般肥料的颜色会变为褐色或黑褐色，铵态氮含量显着增加。
二是看浸出液，腐熟的有机肥加清水（1:5）搅拌后，放置5分钟浸出液颜色。
三是看体积，腐熟堆肥的体积，比刚堆成的条垛塌陷1/3~1/2。
最后，将发酵完成的有机肥在晾晒场上均匀地摊开，厚度不要超过20厘米，并经常翻晒使含水量低于32%。