双断根嫁接是指在嫁接时不但去掉接穗的根，而且切除砧木的本根，促砧木重新发根而成的嫁接育苗方法。
一、砧木选择
砧木宜选用与黄瓜亲和性强、根系再生性好、高抗病性的品种，如南瓜。
二、基质选择
要求疏松，透气性好。如工厂化育苗常用草炭与蛭石按体积比2∶1配制而成。
三、适时播种：
断根嫁接一般在砧木长到一叶一心，接穗子叶平展时进行，因此砧木一般比接穗早播3天左右。
四、出苗前管理：
出苗前白天温度控制在28～30℃，夜间22～25℃。春季嫁接时，砧木齐苗后白天温度控制在20～25℃，夜间12～15℃；秋季嫁接时，白天控制最高温在30℃以下，晚上20℃以内，以防下胚轴徒长。接穗出苗前夜间22～25℃，出苗后白天温度控制在25～28℃，夜间18～20℃，及时脱去种壳。
五、嫁接
1、嫁接一般在室内进行。苗床要适当遮光，温度控制在20～25℃为宜。嫁接工具用70%医用酒清消毒。嫁接前1天，用72.2%普力克水剂600～800倍液加农用链霉素400万单位的混合液喷洒砧木和接穗，直到叶片滴水为止。
2、用刀片将砧木根切掉，生长点到断根处茎长留4～4.5厘米。
3、去掉砧木生长点，用竹签紧贴子叶叶柄中脉基部向另一子叶柄基部成30～45°左右方向斜插，竹签稍穿透砧木表皮，露出竹签尖。
4、在接穗苗子叶基部0.5厘米处平行于子叶斜削一刀，再垂直于子叶将胚轴切成楔形，切面长0.5～0.8厘米。
5、拔出竹签，将切好的接穗迅速准确地斜插入砧木切口内，尖端稍穿透砧木表皮，子叶交叉成十字型。
6、嫁接后立即将断根嫁接苗插入基质，深度在1～1.5厘米，地上部砧木高度3厘米左右。