大棚扣膜以后，一定要注意做到以下几点：
一是扣膜后切忌立即定植蔬菜。因在蔬菜定植前，菜农大都在翻地时施用了大量的鸡粪、鸭粪、稻壳粪等有机肥，这些有机肥有的并没有完全腐熟透，此时若立即定植蔬菜，一是容易烧坏根系，二是有机肥挥发出的氨气容易熏坏幼苗。因此，大棚扣膜后切忌立即定植蔬菜，最好是先关闭风口，提前闷几天棚，以加速鸡粪的腐熟，若在肥中掺入适量的肥力高，则腐熟效果更佳。为赶蔬菜上市时间，大棚扣膜后需要立即定植的蔬菜，定植后要注意加强通风，以防氨气为害。
二是蔬菜定植前要注意暖地。有些菜农认为：我家的鸡粪已腐熟好了，不需要再闷棚了。其实不然，闷棚的另一个作用是暖地。秋未冬初这段时间地温很低，若扣棚后立即定植蔬菜，则蔬菜定植后常因地温低，缓苗慢。而在蔬菜定植前提前扣棚暖地，则有利于蔬菜定植后迅速缓苗。
三是扣膜后注意做好棚内消毒。大棚扣棚后一定要先做好棚内消毒，方可定植蔬菜，以减少蔬菜的发病率。可在扣棚后用硫磺粉熏蒸消毒的方法对大棚空间和棚内农具进行消毒，具体方法为：每亩用硫磺粉1000克加锯末混合，拌匀后分放在大棚各点，将所用农具也一并放入棚内，点燃后密闭温室熏蒸12小时；也可用45%百菌清烟雾剂每亩用药400克熏蒸3-5天消毒灭菌；棚内的墙体、支架、生产工具等也可单独用福尔马林100倍液喷洒消毒；对于土传病害严重的棚地，可用50%的多菌灵和福美双每亩各用4公斤拌适量细土混合均匀，然后撒布在蔬菜定植沟内。以上方法可配合高温闷棚同时进行，注意在蔬菜定植前1-2天一定要打开大棚放风口通风，以免残留的气体对蔬菜造成危害。