根腐病是西红柿种植中常见病，主要危害到西红柿根部，初期主根和茎基部产生褐色斑，后逐渐扩大、凹陷，严重时主根变褐导致腐烂逐渐枯萎。纵剖茎基部与根部，维管束变深褐色，之后根茎腐烂，不生长新根，发病后期，病株多枯萎而死。
病菌发病传播原因
西红柿根腐病原属半知菌亚门真菌，以菌丝体和卵孢子随病残体在土壤中越冬。在苗床内传播主要是带菌的土壤、肥料、农具和浇水等。病菌从幼苗伤口侵入，再借雨水、灌溉水传播。高温、高湿宜于此病发生。苗床连茬、地面积水、施用未腐熟的肥料、地下害虫多、农事活动造成根部伤口多的地块发病较重。
防治措施
1.农业措施。做好苗床土壤消毒工作，培育无病壮苗。平整土地，做好排灌系统、高畦栽培。重病地与非茄果类、瓜类蔬菜实行3年以上轮作。加强水肥管理，适时适量灌水，浇小水，切忌大水漫灌。雨后及时排水，浇水后及雨后适时中耕松土。施用充分腐熟的粪肥，增施磷、钾肥，避免肥料施用不当烧伤根系。初见发病植株及时拔除烧毁。
2.药剂防治。发病初期及时进行药剂防治，用40%乙膦铝可湿性粉剂200倍液或72.2%普力克水剂400-600倍液浇灌苗床，每平方米苗床用药液量2-3公斤;或在移栽前用72.2%普力克水剂400-600倍液浸苗根，也可于移栽后用72.2%普力克水剂400-600倍液灌根。