拖拉机柴油发动机的核心部分是气缸体和活塞组成的缸体。气缸体是发动机的外壳，内部设置有气缸孔，用于容纳活塞。活塞则通过连杆与曲轴相连，通过上下往复运动来实现能量的转换。
燃油系统包括燃油箱、燃油泵、喷油器等多个部件。燃油从燃油箱经由燃油泵供给到喷油器，再通过喷油器喷入气缸内，与空气混合后进行燃烧。
冷却系统由水泵、散热器、风扇等组件构成。水泵通过循环水管将冷却液循环供给到发动机各个部位，以保持其正常运行。
排气系统由排气管、消声器等组件构成。燃烧后的废气通过排气管排出，经过消声器减少噪音，同时减少有害气体的排放。