大豆立枯病主要危害幼苗的茎基部或地下根部，初期病斑呈椭圆形或不规则形状，暗褐色。发病幼苗早期表现为白天萎蔫，夜间恢复，病部逐渐凹陷、溢缩，甚至变为黑褐色。当病斑扩大绕茎一周时，植株干枯死亡，但仍不倒伏。轻度发病植株仅出现褐色凹陷病斑而不枯死。苗床湿度大时，病部可见淡褐色蛛丝状霉。立枯病不产生絮状白霉、不倒伏且病程进展慢，可区别于猝倒病。大豆立枯病仅在苗期发生，幼苗和幼株主根及近地面茎基部出现红褐色稍凹陷的病斑，皮层开裂呈溃疡状。病菌的菌丝最初无色，以后逐渐变为褐色。病害严重时，植株外形矮小，生育迟缓，靠地面的茎赤褐色，皮层开裂，呈溃疡状。