选无病土做营养土，营养土中的有机肥要充分腐熟。营养钵浇水要一次浇透，待水充分渗下后才能播种。不可把种芽直接插入营养土中，先用筷粗似的细棒在营养钵中捣个穴后，把芽放入穴中。选用抗病、包衣的种子，如未包衣，则用拌种剂或浸种剂灭菌后才催芽、播种。出苗后，严格控制温度、湿度及光照，可结合练苗，揭膜、通风、排湿。播种后用药土做覆盖土，发病后用药土围根或喷药。营养土在使用前，最少要晒三周以上。采用营养钵育苗的，移栽时用双多悬浮剂(西瓜重茬剂)600~700倍液灌穴，每穴灌对好的药液400~450毫升。药土盖种，采用苗床育苗的，药剂处理土壤方法和用药量参见苦瓜猝倒病。选用优质种子，播前种子消毒。合理轮作，土壤消毒。出苗期喷雾杀菌剂防治2次，每次间隔7至10天。西瓜猝倒病一般发生在苗期，农业防治方法控制苗床水分宁干勿湿，药剂防治用瑞苗清浇泼发病苗床。加强营养土、苗床的药剂处理，育瓜苗的苗床和营养土进行药剂处理是防止苗期病害的关键措施。一般可用8－10克/平方米的以下药剂进行处理：50％多菌灵、70％甲基托布津、75％百菌清、70％敌克松等，上述药剂按1：30细土混匀后撒施苗床，或按0.3％比例混在营养钵中的营养土里。西瓜猝倒病防治，轮作，选无病土做营养土，一次浇透水。在发病严重的地区采用统一供苗移植的办法防治。