西瓜疫病在幼苗和成株均可发病,主要危害叶、茎及果实。子叶染病时,先出现水浸状暗绿色圆形斑,中央逐渐变成红褐色,近地面处缢缩或枯死。真叶染病时,初生暗绿色水浸状圆形或不整形病斑,迅速扩展,湿度大时腐烂或像开水烫过,干后为淡褐色,易破碎。茎基部染病时,生纺锤形水浸状暗绿色凹陷斑,包围茎部且腐烂,患部以上全部枯死。果实染病时,形成暗绿色圆形水浸状凹陷斑,后迅速扩及全果,致果实腐烂。