预防冬瓜褐腐病需要加强棚室温湿度管理，注意通风排湿。严禁大水漫灌。白天温度控制在23—28℃，相对湿度控制在60%—75%，夜间温度控制在13—15℃，相对湿度控制在80%—95%。花期和幼瓜期适时喷洒69%安克锰锌可湿性粉剂600倍液，视天气情况每隔7—10天喷1次，共喷2—3次。及时摘除残存花瓣和冬瓜褐腐病病瓜并深埋。选择优良品种，加强田间管理，及时防病虫害。冬瓜与非瓜类作物实行3年以上轮作。冬瓜选择地势高燥地块。采用高畦栽培，注意通风，雨后及时排水。在冬瓜开花至幼果期，喷施64%杀毒矾可湿性粉剂400～500倍液、或50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液、或70%甲基托布津可湿性粉剂800~1000倍液、或50%多菌灵可湿性粉剂500~800倍液防治，隔10天喷1次，连续2～3次。田间通风降湿，禁止瓜地大水漫灌等农业防治，辅以化学防治。