黄瓜黑星病的病菌以菌丝体在病残体内于田间土壤中或支架上越冬，成为第二年初侵染源；也可以分生孢子附着在种子表面，或以菌丝潜伏在种皮内越冬，病菌可直接侵害幼苗。发病特点为相对湿度85%左右易发病，适应温度范围较广，17℃易发病。病菌可直接穿透表皮，或从气孔和伤口侵入。冬春季节，温度较低，露水较多，阴雨寡照情况较多，这种情况下易发病，并且传播速度较快。真菌引起病害，病菌随病残体在土壤中越冬，靠风雨、气流、农事操作传播。种子可以带菌。冷凉多雨，容易发病。一般在定植后到结瓜期发病最多，大棚最低温度低于10℃，相对湿度高于90%时容易发生。