茄子根腐病是一种土传性病害，因此在种植时应将种子和土壤进行消毒再育苗，定植后使用强力生根剂促进生根壮根。如果出现病情，及时使用咯菌腈悬浮剂加精甲霜锰锌水分散颗粒剂进行浇灌防治。
轮作倒茬，采用高畦栽培，整好土地，防止大水漫灌，苗期染病要及时松土。
