小麦秆锈病主要发生在华东沿海、长江流域、南方冬麦区及东北、华北的内蒙古、西北春麦区。该病主要侵害叶鞘和茎秆，也影响叶片和穗部。夏孢子堆大，呈长椭圆形，深褐色或褐黄色，排列不规则且散生，常连接成大斑。成熟后表皮易破裂，大片开裂并向外翻成唇状，散出大量锈褐色粉末，即夏孢子。小麦成熟时，在夏孢子堆及其附近出现黑色椭圆至长条形冬孢子堆，后表皮破裂，散出黑色粉末状物，即冬孢子。三种锈病区别可用“条锈成行叶锈乱，秆锈是个大红斑”来概括。小麦秆锈病的症状表现包括茎杆有褐色斑后变黄色霉状。
