冬瓜疫病症状主要影响苗期和成株期的植株，尤其危害瓜果、茎、叶等部位。在苗期，受感染的茎叶部分会出现水渍状病变，随后导致萎蔫并枯死。成株期的病变通常从茎节部开始，表现为暗绿色、凹陷缢缩，上部叶片虽然出现萎蔫现象，但维管束颜色保持不变。叶片受害时，会形成水渍状的不规则形或圆形灰绿色大斑，在潮湿环境下更易产生白霉，最终可能导致腐烂和枯死。瓜果受害后，表面会出现黄褐色水渍状病斑，随后病部凹陷，覆盖白色霉层并引发腐烂，同时伴有恶臭。
