玉米茎腐病主要为害根系和茎基，病原菌自根系侵入，在植株体内蔓延扩展。病苗根部或茎基部的木质部变褐，严重的初生根、次生根坏死、腐烂，造成根部和茎基部腐烂，引起倒伏或整株枯死；地上部表现为中下部叶片边缘变黄、变褐，严重的整株叶片枯黄。在玉米中部的叶鞘和茎秆上发生水浸状腐烂，引起组织软化，并有腥臭味。一般在玉米大喇叭口期开始发病。首先植株中下部的叶鞘和茎秆上出现不规则的水浸状病斑，病菌在浸染茎秆和心叶的过程中，造成生长点组织坏死、腐烂，并散发出腥臭味。病株容易从病部折断，不能抽穗或结实，一般发病率即相当于损失率。