大豆荚枯病的发生与流行主要与结荚期的降雨量有关。在连阴雨天气多的年份,该病容易发生且病情较重。在南方地区,8月至10月是易发病期,而北方地区则在8月至9月较为常见。气候条件如连续阴雨、低温寡照,以及雨水量过大都是诱发大豆荚枯病的重要因素。