大豆菌核病的发生与多种因素相关。首先，高湿度和过密的种植密度是重要条件，尤其在阴雨连绵的年份和低洼地势更为严重。重茬地和大豆生长过于繁茂的地段，特别是施用过量的氮肥，导致茎秆软弱和易倒伏，也会加剧病情。此外，扬花期较长的品种更容易感病。为了减轻病害，宽垄种植和增加株间通风是有效方法。同时，与易感病作物轮作也会影响发病程度。
