发现病株及早拔除。由尖镰孢菌、黄色镰孢菌引起的茎腐病，发病初期可用50%多菌灵500倍液，或70%甲基硫菌灵800倍液灌根；对烟草疫霉为主引起的茎腐病，可用77%多宁600倍液灌根，结合用72%克露600倍液喷施茎基部。对发生茎腐病的田块，发现病株后也要及时拔除，并对病穴用生石灰消毒。同时喷施50%多硫悬浮剂500倍液，或50%乙铝锰锌可湿性粉剂600倍液防治，7～10天一次，连续防治2～3次。连续阴雨天发病时，可每亩用10%腐霉利烟剂或45%百菌清烟剂250～300克，于傍晚均匀布点，闭棚熏一夜，每隔5-7天一次，连续防治2～3次，有较好的控病防治效果。