油菜的主要病害是菌核病、霜霉病、白锈病和病毒病，主要害虫是蚜虫。菌核病俗称"白秆"、"烂秆"，发病率一般10%～30%，减产一至三成，重者五成以上。栽培技术上要深沟窄厢、清沟排渍，及时清除老黄叶。蚜虫是油菜甚至农作物上非常常见的虫害之一，主要危害油菜的幼嫩枝叶，大量的蚜虫在油菜幼叶的背部或顶稍吸食汁液，造成油菜的幼嫩叶片卷缩停止生长或生长缓慢，对油菜的危害极大。
