小麦受纹枯菌侵染后，在各生育阶段出现烂芽、病苗枯死、花秆烂茎、枯株白穗等症状。该病主要发生在小麦的叶鞘和茎秆上，拔节后症状逐渐明显。发病初期，在地表或近地表的叶鞘上产生黄褐色椭圆形或梭形病斑，病部逐渐扩大，颜色变深，并向内侧发展为害茎部，重病株基部一、二节变黑甚至腐烂，常早期死亡。小麦生长中期至后期，叶鞘上的病斑呈云纹状花纹，严重时包围全叶鞘，使叶鞘及叶片早枯。在田间湿度大、通气性不好的条件下，病鞘与茎秆之间或病斑表面常产生白色霉状物，初期散生土黄色或黄褐色的霉状小团，担孢子单细胞，椭圆形或长椭圆形，基部稍尖，无色。小麦纹枯病的症状表现是叶鞘上产生黄褐色椭圆形及梭形病斑，茎部变黑病苗枯死等。