茼蒿叶斑病的病原称菊叶点霉,属半知菌亚门真菌。其分生孢子器呈球形至凸镜形,初期埋生于组织中,随后外突或仅通过孔口突破表皮外露,大小范围为80至100微米。分生孢子梗短小,而分生孢子则呈椭圆形,单胞无色或颜色浅淡,大小为4至5微米×2.5至3微米。这些特征共同构成了茼蒿叶斑病的病原特征。