病菌以卵孢子和菌丝形态附在叶片上越冬，翌年形成分生孢子后，成为初侵染源。分生孢子在夜间形成，白天飞散。泡于从叶片气孔处侵入，经5～10日潜伏期发病，叶表面形成许多分生孢子，成为再侵染源。病菌主要以卵孢子随病残体在土壤中存活。秋季侵染幼苗引起系统侵染或种株鳞茎内的菌丝体形成系统侵染。南方气候温暖地区可随病株在田间存活。侵染后病斑上的孢子囊借风雨传播，从气孔侵入形成再次侵染。相对湿度90%以上、气温15度左右最易发病。低温多雨重雾天气病害流行。在重荐地、低洼地、大水漫灌、过度密植、生长不良等地发病重。大葱霜毒病主要是从叶片气孔侵入，经过5-10天的潜夫期，叶表面形成。凉爽高湿的天气有利于病原菌发育和病害发生。气温l5℃左右，降雨较多时有利于发病。4月中旬至5月上旬（东北地区5~6月份）持续阴雨或经常出现重雾、大雾时，霜霉病可能大流行。地势低洼、大水漫灌、密植和生长不良的地块发病尤重。夏季温度高，发病受抑制。秋季发病程度也与雨量成正相关，灌水不当也诱使发病加重。秋季病重田块，翌年春季发病也重。