选择通风良好、远离萝卜、黄瓜、房屋的地块种植菠菜；适时播种，避免早播；遇到春旱和秋旱，应多浇水，可减轻发病；施足有机肥，增施磷钾肥，提高抗病力。在冬前和早春应将田间、地边及垄沟的杂草清除干净，并彻底清除病株，带出田外深埋或烧毁。及时用药剂防治蚜虫，特别是冬前菠菜苗期。发病前或发病初期可喷20%病毒A可湿性粉剂500倍液，或5%菌毒清水剂300倍液、抗毒剂1号300倍液，增强免疫力。菠菜病毒病会矮化植株，结果不良。在种植时，应及时除草，并防治蚜虫，避免传染病源。发现病情后，及时用药防治，如喷施病毒A可湿性粉剂、菌毒清水剂等农药。前期引起植株矮化、花叶、叶片黑色坏死脱落，后期引起丛枝、旅叶、花蕾和幼果枯萎，整株黄化落叶。发病严重时，减产明显甚至绝收。