芝麻枯萎病和立枯病是影响芝麻生长的两种主要病害。枯萎病由菌丝潜伏在种子内或随病残体在土壤中越冬，翌年侵染幼苗的根，从根尖或伤口侵入。连作地、土温高、湿度大的瘠薄砂壤土易发病，品种间抗病性有差异。立枯病初发病时，芝麻茎基部或地下部一侧呈黄色至黄褐色条斑，逐渐凹陷腐烂，后绕茎部扩展，最后茎部统缩成线状，幼苗折倒。轻病苗有时能恢复生长，病部皮层变褐缢缩，遇有天气干旱或土壤缺水时，下部叶片萎蔫，严重时枯死。
