芝麻病毒病主要靠蚜虫传播，也可通过土壤、种子带菌和株体伤口传播。生产上应及时防治蚜虫，以减少病毒病的发生。芝麻病害有多种侵染方式，包括从根系的根尖和伤口侵入、从叶片气孔侵入、侵染花、蕾、蒴等部位，以及通过土壤和种子传播。了解这些侵染方式和传播途径，有助于有效防治病害。
芝麻虫害中，蚜虫、盲椿象等属于刺吸式口器害虫，应在点片危害阶段使用内吸剂农药集中歼灭。鳞翅目害虫如芝麻螟、地老虎等，主要以幼虫危害芝麻，属于咀嚼式口器害虫。3龄前幼虫虫体小、食量少、危害轻、抗药性差且比较集中，易被歼灭。防治时应以胃毒剂药剂为主，抓住幼虫3龄前的有利时机。对于金针虫、蛴螬等地下害虫，应根据发生的虫害种类，主要通过土壤处理和药剂拌种进行防治。
芝麻普通花叶病主要由芜菁花叶病毒引起，该病毒由桃蚜、花生蚜和大豆蚜等进行非持久性传播，也可经汁液传染。病毒从根系的根尖和伤口侵入，借助土壤、种子带菌和蚜虫等途径传播。