胡萝卜在洗过后长时间放置可能会发生腐霉病，这并非出土时就存在的问题。为了避免这种情况，应尽量避免连作，最好实行3—4年的轮作。对于排水不良的地块，如湿地或转换田，应通过改善排水系统，如挖设暗渠等方法来防止病害。如果无法避免在前一年发病的田地里连作，务必进行土壤消毒。此外，种植春播型胡萝卜时，应适时收获，防止因延期收获而增加病害的风险。
