番茄斑枯病以菌丝体和分生孢子器在土中的病残体、种子或多年生茄科杂草上越冬，翌年产生的分生孢子是病害的初侵染来源。病菌分生孢子借风、雨水及农事操作传播到寄主，从寄主表皮萌发后通过气孔侵入，菌丝在细胞间蔓延，以分枝的吸器穿入寄主细胞内吸取养分。菌丝成熟后形成新的分生孢子器和分生孢子，进行再次侵染。
