水稻穗颈瘟的发病条件，有大量的易感品种和病原物，加入适宜的气候条件。
水稻穗颈瘟主要在穗颈、穗轴、枝梗上发生，早期发病或发病较重造成白穗，晚期发病容易轻形成秕粒。穗颈瘟可以使穗梗折断，造成严重减产。发病中心病株借风雨和磨擦进行传播，温度在26～28℃、相对湿度90%以上最适合蔓延。尤其阴雨连绵、日照不足、时晴时雨、早晚有雾以及结露条件下，病情迅速扩展。
在超过30度高温、湿度大于60%时容易发生。
