①低温造成花芽分化和发育异常，夜温连续低于6℃，易造成冬春茬番茄1〜2穗果畸形;②激素使用不当造成，为防止番茄落花落果，常采用10%对氯苯氧乙酸（红茄灵）蘸花，但浓度掌握不准、重复蘸花、蘸花时温度高、花未开展、土壤干旱等均易产生籽外露果、疤果、爪形果、桃形果等畸形果;③偏施氮肥，致使花芽过度分化，形成多心室畸形果;④肥水管理不当，忽干忽湿，易形成裂果和脐腐果;⑤高温低湿、光照不足等易形成空洞果;⑥病毒病引起的果面凹凸、着色不良的畸形果。
西红柿畸形既有品种的原因，也有管理不当等。
