首先要合理密植，轮作，深翻，加强水肥管理。胡萝卜菌核病防治方法包括：1、合理轮作，重病区或重病地与禾本科作物进行3年以上轮作，有条件的采用土壤淹水，以杀灭菌核；2、加强肥水管理；3、药物防治，做好种子处理，水肥平发生病虫害初期喷施杀菌剂。装运胡萝卜的器具应消毒，入窖前剔除有病肉质根。窖温应控制在13℃上下，相对湿度80%左右，防止窖顶滴水和受冻。
