冬瓜褐斑病菌丝无色，细长，具分枝。分生孢子梗生于叶两面、多单生，个别3-5根丛生，丛生的有子座；分生孢子梗不分枝，具分隔1-7个，褐色，大小为（150一650）微米X(5-8)微米；分生孢子顶生在梗端，单生或串生，棍棒状，直立或略弯，浅褐色，顶端钝圆，基部膨大，有2-7分隔，分隔处无缢缩，分生孢子大小(41.3-286.7)微米X(8.5-17)微米；厚垣孢子壁厚，粗短，深褐色。该病病原菌为瓜棒孢霉，属半知菌亚门真菌。
